Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSR1P43307 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSR1P43307 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSR1P43307 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSR1P43307 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSR1P43307 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSR1P43307 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSR1P43307 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSR1P43307 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSR1P43307 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSR1P43307 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSR1P43307 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSR1P43307 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSR1P43307 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SSR1P43307 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSR1P43307 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSR1P43307 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSR1P43307 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSR1P43307 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSR1P43307 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSR1P43307 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSR1P43307 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSR1P43307 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSR1P43307 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSR1P43307 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSR1P43307 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSR1P43307 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSR1P43307 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSR1P43307 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSR1P43307 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSR1P43307 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSR1P43307 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSR1P43307 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSR1P43307 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSR1P43307 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSR1P43307 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSR1P43307 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSR1P43307 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSR1P43307 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSR1P43307 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSR1P43307 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSR1P43307 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSR1P43307 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSR1P43307 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSR1P43307 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSR1P43307 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SSR1P43307 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSR1P43307 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSR1P43307 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSR1P43307 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSR1P43307 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSR1P43307 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSR1P43307 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSR1P43307 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSR1P43307 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSR1P43307 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSR1P43307 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSR1P43307 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSR1P43307 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSR1P43307 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSR1P43307 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSR1P43307 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSR1P43307 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSR1P43307 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SSR1P43307 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSR1P43307 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSR1P43307 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSR1P43307 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSR1P43307 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSR1P43307 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSR1P43307 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSR1P43307 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSR1P43307 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSR1P43307 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSR1P43307 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSR1P43307 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSR1P43307 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSR1P43307 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSR1P43307 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSR1P43307 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSR1P43307 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSR1P43307 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSR1P43307 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSR1P43307 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSR1P43307 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSR1P43307 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSR1P43307 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSR1P43307 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSR1P43307 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSR1P43307 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSR1P43307 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSR1P43307 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSR1P43307 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SSR1P43307 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSR1P43307 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSR1P43307 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSR1P43307 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSR1P43307 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSR1P43307 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSR1P43307 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms