Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV4P43268 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV4P43268 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV4P43268 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV4P43268 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV4P43268 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV4P43268 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV4P43268 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV4P43268 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV4P43268 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV4P43268 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV4P43268 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV4P43268 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV4P43268 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV4P43268 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV4P43268 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV4P43268 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV4P43268 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV4P43268 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV4P43268 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV4P43268 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV4P43268 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV4P43268 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV4P43268 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV4P43268 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV4P43268 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETV4P43268 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETV4P43268 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETV4P43268 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETV4P43268 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETV4P43268 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETV4P43268 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETV4P43268 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETV4P43268 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETV4P43268 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETV4P43268 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ETV4P43268 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ETV4P43268 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETV4P43268 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETV4P43268 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETV4P43268 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETV4P43268 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETV4P43268 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETV4P43268 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETV4P43268 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETV4P43268 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETV4P43268 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ETV4P43268 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ETV4P43268 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ETV4P43268 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ETV4P43268 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ETV4P43268 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ETV4P43268 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ETV4P43268 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ETV4P43268 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ETV4P43268 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ETV4P43268 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ETV4P43268 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ETV4P43268 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ETV4P43268 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ETV4P43268 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ETV4P43268 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETV4P43268 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ETV4P43268 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETV4P43268 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETV4P43268 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETV4P43268 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETV4P43268 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETV4P43268 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETV4P43268 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETV4P43268 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETV4P43268 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETV4P43268 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETV4P43268 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETV4P43268 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETV4P43268 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETV4P43268 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETV4P43268 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ETV4P43268 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETV4P43268 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETV4P43268 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ETV4P43268 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETV4P43268 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETV4P43268 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETV4P43268 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETV4P43268 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETV4P43268 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETV4P43268 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ETV4P43268 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETV4P43268 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETV4P43268 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETV4P43268 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETV4P43268 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETV4P43268 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ETV4P43268 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETV4P43268 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETV4P43268 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETV4P43268 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETV4P43268 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETV4P43268 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms