Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFSF9P41273 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms