Protein–RNA interactions for Protein: P40080

VFA1, VPS4-associated protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1P40080 GCD10YNL062C 1437 nt2.76□□□□□ -1.97
VFA1P40080 ARP8YOR141C 2646 nt2.75□□□□□ -1.97
VFA1P40080 CYR1YJL005W 6081 nt2.75□□□□□ -1.97
VFA1P40080 YSW1YBR148W 1830 nt2.75□□□□□ -1.97
VFA1P40080 DIE2YGR227W 1578 nt2.75□□□□□ -1.97
VFA1P40080 PTP3YER075C 2787 nt2.75□□□□□ -1.97
VFA1P40080 TPS2YDR074W 2691 nt2.75□□□□□ -1.97
VFA1P40080 PUF6YDR496C 1971 nt2.75□□□□□ -1.97
VFA1P40080 YDL068WYDL068W 330 nt2.75□□□□□ -1.97
VFA1P40080 snR76snR76 109 nt2.75□□□□□ -1.97
VFA1P40080 PRE8YML092C 753 nt2.75□□□□□ -1.97
VFA1P40080 MGR1YCL044C 1254 nt2.75□□□□□ -1.97
VFA1P40080 PSK2YOL045W 3306 nt2.75□□□□□ -1.97
VFA1P40080 GNT1YOR320C 1476 nt2.75□□□□□ -1.97
VFA1P40080 NUP82YJL061W 2142 nt2.75□□□□□ -1.97
VFA1P40080 SNX41YDR425W 1878 nt2.75□□□□□ -1.97
VFA1P40080 ASG1YIL130W 2895 nt2.75□□□□□ -1.97
VFA1P40080 SLH1YGR271W 5904 nt2.74□□□□□ -1.97
VFA1P40080 MRD1YPR112C 2664 nt2.74□□□□□ -1.97
VFA1P40080 SKT5YBL061C 2091 nt2.74□□□□□ -1.97
VFA1P40080 YJL016WYJL016W 1686 nt2.74□□□□□ -1.97
VFA1P40080 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.74□□□□□ -1.97
VFA1P40080 RPL40AYIL148W 387 nt2.74□□□□□ -1.97
VFA1P40080 LCL2YLR104W 396 nt2.74□□□□□ -1.97
VFA1P40080 DNL4YOR005C 2835 nt2.74□□□□□ -1.97
VFA1P40080 YJL181WYJL181W 1836 nt2.73□□□□□ -1.97
VFA1P40080 SAP1YER047C 2694 nt2.73□□□□□ -1.97
VFA1P40080 GIS4YML006C 2325 nt2.73□□□□□ -1.97
VFA1P40080 AAD16YFL057C 459 nt2.73□□□□□ -1.97
VFA1P40080 YOR055WYOR055W 435 nt2.73□□□□□ -1.97
VFA1P40080 YPR197CYPR197C 564 nt2.73□□□□□ -1.97
VFA1P40080 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.73□□□□□ -1.97
VFA1P40080 BAS1YKR099W 2436 nt2.73□□□□□ -1.97
VFA1P40080 TOM1YDR457W 9807 nt2.73□□□□□ -1.97
VFA1P40080 SLN1YIL147C 3663 nt2.72□□□□□ -1.97
VFA1P40080 CAJ1YER048C 1176 nt2.72□□□□□ -1.97
VFA1P40080 YER076W-AYER076W-A 348 nt2.72□□□□□ -1.97
VFA1P40080 KEL2YGR238C 2649 nt2.72□□□□□ -1.97
VFA1P40080 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.72□□□□□ -1.97
VFA1P40080 RAM2YKL019W 951 nt2.72□□□□□ -1.97
VFA1P40080 RPS22BYLR367W 393 nt2.72□□□□□ -1.97
VFA1P40080 COX7YMR256C 183 nt2.72□□□□□ -1.97
VFA1P40080 RPL25YOL127W 429 nt2.72□□□□□ -1.97
VFA1P40080 YOR146WYOR146W 306 nt2.72□□□□□ -1.97
VFA1P40080 YBR197CYBR197C 654 nt2.72□□□□□ -1.97
VFA1P40080 RIF1YBR275C 5751 nt2.72□□□□□ -1.97
VFA1P40080 VPS52YDR484W 1926 nt2.72□□□□□ -1.97
VFA1P40080 DUG2YBR281C 2637 nt2.72□□□□□ -1.97
VFA1P40080 RPS20YHL015W 366 nt2.71□□□□□ -1.98
VFA1P40080 CCW14YLR390W-A 717 nt2.71□□□□□ -1.98
VFA1P40080 RPS12YOR369C 432 nt2.71□□□□□ -1.98
VFA1P40080 LCL1YPL056C 306 nt2.71□□□□□ -1.98
VFA1P40080 ROM1YGR070W 3468 nt2.7□□□□□ -1.98
VFA1P40080 YDL041WYDL041W 354 nt2.7□□□□□ -1.98
VFA1P40080 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.7□□□□□ -1.98
VFA1P40080 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.7□□□□□ -1.98
VFA1P40080 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.7□□□□□ -1.98
VFA1P40080 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.7□□□□□ -1.98
VFA1P40080 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.7□□□□□ -1.98
VFA1P40080 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.7□□□□□ -1.98
VFA1P40080 YOR050CYOR050C 348 nt2.7□□□□□ -1.98
VFA1P40080 YOR121CYOR121C 306 nt2.7□□□□□ -1.98
VFA1P40080 EGD1YPL037C 474 nt2.7□□□□□ -1.98
VFA1P40080 FIR1YER032W 2631 nt2.7□□□□□ -1.98
VFA1P40080 COX1Q0045 1605 nt2.69□□□□□ -1.98
VFA1P40080 YER137W-AYER137W-A 306 nt2.69□□□□□ -1.98
VFA1P40080 URM1YIL008W 300 nt2.69□□□□□ -1.98
VFA1P40080 YML003WYML003W 873 nt2.69□□□□□ -1.98
VFA1P40080 FPR1YNL135C 345 nt2.69□□□□□ -1.98
VFA1P40080 MSL5YLR116W 1431 nt2.68□□□□□ -1.98
VFA1P40080 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.68□□□□□ -1.98
VFA1P40080 YPL238CYPL238C 390 nt2.68□□□□□ -1.98
VFA1P40080 YGR035CYGR035C 351 nt2.67□□□□□ -1.98
VFA1P40080 PRP8YHR165C 7242 nt2.67□□□□□ -1.98
VFA1P40080 RNP1YLL046C 750 nt2.67□□□□□ -1.98
VFA1P40080 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt2.67□□□□□ -1.98
VFA1P40080 ATP3YBR039W 936 nt2.67□□□□□ -1.98
VFA1P40080 GCV2YMR189W 3105 nt2.67□□□□□ -1.98
VFA1P40080 FLO11YIR019C 4104 nt2.66□□□□□ -1.98
VFA1P40080 DNA2YHR164C 4569 nt2.66□□□□□ -1.98
VFA1P40080 STE11YLR362W 2154 nt2.66□□□□□ -1.98
VFA1P40080 RTT102YGR275W 474 nt2.66□□□□□ -1.98
VFA1P40080 YLR031WYLR031W 561 nt2.66□□□□□ -1.98
VFA1P40080 ROX1YPR065W 1107 nt2.66□□□□□ -1.98
VFA1P40080 RGA2YDR379W 3030 nt2.66□□□□□ -1.98
VFA1P40080 SSN2YDR443C 4263 nt2.65□□□□□ -1.98
VFA1P40080 SAK1YER129W 3429 nt2.65□□□□□ -1.98
VFA1P40080 SDC25YLL016W 3147 nt2.65□□□□□ -1.98
VFA1P40080 IRC10YOL015W 1761 nt2.65□□□□□ -1.99
VFA1P40080 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt2.65□□□□□ -1.99
VFA1P40080 RPL36AYMR194W 303 nt2.65□□□□□ -1.99
VFA1P40080 YBL071CYBL071C 309 nt2.65□□□□□ -1.99
VFA1P40080 PHO91YNR013C 2685 nt2.65□□□□□ -1.99
VFA1P40080 SWT1YOR166C 1377 nt2.64□□□□□ -1.99
VFA1P40080 YPR089WYPR089W 2667 nt2.64□□□□□ -1.99
VFA1P40080 YEL057CYEL057C 702 nt2.64□□□□□ -1.99
VFA1P40080 YJR011CYJR011C 786 nt2.64□□□□□ -1.99
VFA1P40080 TMA22YJR014W 597 nt2.64□□□□□ -1.99
VFA1P40080 COQ10YOL008W 624 nt2.64□□□□□ -1.99
VFA1P40080 CDC24YAL041W 2565 nt2.64□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 76.4 ms