Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT2P35908 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT2P35908 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT2P35908 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT2P35908 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT2P35908 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT2P35908 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT2P35908 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT2P35908 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT2P35908 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT2P35908 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT2P35908 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT2P35908 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT2P35908 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT2P35908 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT2P35908 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT2P35908 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT2P35908 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT2P35908 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT2P35908 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT2P35908 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT2P35908 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT2P35908 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT2P35908 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT2P35908 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT2P35908 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT2P35908 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT2P35908 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT2P35908 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT2P35908 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT2P35908 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT2P35908 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT2P35908 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT2P35908 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT2P35908 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT2P35908 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT2P35908 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT2P35908 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT2P35908 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT2P35908 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT2P35908 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT2P35908 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT2P35908 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT2P35908 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT2P35908 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT2P35908 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT2P35908 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT2P35908 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT2P35908 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT2P35908 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT2P35908 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT2P35908 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT2P35908 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT2P35908 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT2P35908 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT2P35908 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT2P35908 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT2P35908 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT2P35908 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT2P35908 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT2P35908 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT2P35908 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT2P35908 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT2P35908 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT2P35908 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT2P35908 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT2P35908 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT2P35908 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT2P35908 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT2P35908 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT2P35908 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT2P35908 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT2P35908 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT2P35908 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT2P35908 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT2P35908 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT2P35908 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT2P35908 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT2P35908 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT2P35908 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT2P35908 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT2P35908 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT2P35908 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT2P35908 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT2P35908 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT2P35908 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT2P35908 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT2P35908 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT2P35908 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT2P35908 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT2P35908 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT2P35908 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT2P35908 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT2P35908 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT2P35908 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT2P35908 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT2P35908 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT2P35908 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT2P35908 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT2P35908 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms