Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GPC1P35052 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GPC1P35052 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPC1P35052 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPC1P35052 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPC1P35052 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPC1P35052 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPC1P35052 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPC1P35052 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPC1P35052 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GPC1P35052 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GPC1P35052 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPC1P35052 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPC1P35052 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GPC1P35052 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPC1P35052 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPC1P35052 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPC1P35052 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPC1P35052 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPC1P35052 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPC1P35052 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPC1P35052 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPC1P35052 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPC1P35052 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPC1P35052 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPC1P35052 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPC1P35052 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GPC1P35052 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GPC1P35052 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPC1P35052 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPC1P35052 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPC1P35052 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPC1P35052 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPC1P35052 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPC1P35052 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPC1P35052 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPC1P35052 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPC1P35052 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPC1P35052 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPC1P35052 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPC1P35052 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPC1P35052 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPC1P35052 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPC1P35052 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPC1P35052 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GPC1P35052 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPC1P35052 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPC1P35052 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPC1P35052 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPC1P35052 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPC1P35052 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPC1P35052 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPC1P35052 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPC1P35052 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPC1P35052 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPC1P35052 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPC1P35052 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPC1P35052 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPC1P35052 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPC1P35052 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPC1P35052 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPC1P35052 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPC1P35052 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPC1P35052 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPC1P35052 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPC1P35052 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPC1P35052 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPC1P35052 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPC1P35052 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPC1P35052 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPC1P35052 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPC1P35052 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPC1P35052 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GPC1P35052 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPC1P35052 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPC1P35052 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPC1P35052 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPC1P35052 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPC1P35052 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GPC1P35052 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPC1P35052 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPC1P35052 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPC1P35052 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPC1P35052 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPC1P35052 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPC1P35052 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GPC1P35052 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPC1P35052 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GPC1P35052 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPC1P35052 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPC1P35052 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPC1P35052 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPC1P35052 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPC1P35052 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPC1P35052 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPC1P35052 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GPC1P35052 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPC1P35052 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPC1P35052 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPC1P35052 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms