Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCR5P32302 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCR5P32302 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCR5P32302 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCR5P32302 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCR5P32302 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCR5P32302 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCR5P32302 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCR5P32302 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCR5P32302 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCR5P32302 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCR5P32302 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCR5P32302 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCR5P32302 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCR5P32302 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCR5P32302 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCR5P32302 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCR5P32302 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCR5P32302 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCR5P32302 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCR5P32302 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCR5P32302 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCR5P32302 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCR5P32302 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCR5P32302 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCR5P32302 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCR5P32302 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCR5P32302 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCR5P32302 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCR5P32302 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCR5P32302 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCR5P32302 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCR5P32302 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCR5P32302 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCR5P32302 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCR5P32302 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCR5P32302 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCR5P32302 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCR5P32302 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCR5P32302 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCR5P32302 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCR5P32302 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCR5P32302 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms