Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKARP32238 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKARP32238 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKARP32238 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKARP32238 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKARP32238 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKARP32238 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKARP32238 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKARP32238 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKARP32238 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKARP32238 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKARP32238 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKARP32238 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKARP32238 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKARP32238 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKARP32238 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKARP32238 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKARP32238 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCKARP32238 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCKARP32238 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCKARP32238 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCKARP32238 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCKARP32238 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCKARP32238 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCKARP32238 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCKARP32238 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCKARP32238 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCKARP32238 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCKARP32238 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCKARP32238 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCKARP32238 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCKARP32238 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCKARP32238 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCKARP32238 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCKARP32238 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCKARP32238 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCKARP32238 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCKARP32238 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCKARP32238 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCKARP32238 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCKARP32238 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCKARP32238 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCKARP32238 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCKARP32238 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCKARP32238 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCKARP32238 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCKARP32238 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCKARP32238 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCKARP32238 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCKARP32238 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCKARP32238 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCKARP32238 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCKARP32238 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCKARP32238 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCKARP32238 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCKARP32238 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCKARP32238 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCKARP32238 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCKARP32238 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCKARP32238 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCKARP32238 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCKARP32238 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCKARP32238 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCKARP32238 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCKARP32238 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCKARP32238 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCKARP32238 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCKARP32238 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCKARP32238 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCKARP32238 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCKARP32238 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCKARP32238 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCKARP32238 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCKARP32238 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCKARP32238 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCKARP32238 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCKARP32238 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCKARP32238 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCKARP32238 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCKARP32238 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCKARP32238 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCKARP32238 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCKARP32238 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCKARP32238 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCKARP32238 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCKARP32238 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCKARP32238 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCKARP32238 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCKARP32238 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCKARP32238 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCKARP32238 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCKARP32238 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCKARP32238 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCKARP32238 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCKARP32238 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCKARP32238 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCKARP32238 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCKARP32238 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCKARP32238 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCKARP32238 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms