Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms