Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms