Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms