Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCAP28676 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GCAP28676 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCAP28676 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GCAP28676 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GCAP28676 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
GCAP28676 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
GCAP28676 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCAP28676 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCAP28676 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCAP28676 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCAP28676 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCAP28676 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCAP28676 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCAP28676 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCAP28676 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCAP28676 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCAP28676 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GCAP28676 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GCAP28676 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GCAP28676 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCAP28676 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCAP28676 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCAP28676 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCAP28676 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCAP28676 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCAP28676 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCAP28676 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCAP28676 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCAP28676 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GCAP28676 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCAP28676 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCAP28676 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCAP28676 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCAP28676 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCAP28676 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCAP28676 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCAP28676 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCAP28676 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCAP28676 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCAP28676 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCAP28676 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCAP28676 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCAP28676 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCAP28676 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCAP28676 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GCAP28676 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCAP28676 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCAP28676 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCAP28676 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCAP28676 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCAP28676 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCAP28676 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GCAP28676 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCAP28676 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCAP28676 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCAP28676 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCAP28676 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GCAP28676 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCAP28676 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GCAP28676 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCAP28676 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCAP28676 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCAP28676 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GCAP28676 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCAP28676 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCAP28676 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCAP28676 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCAP28676 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCAP28676 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCAP28676 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCAP28676 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCAP28676 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCAP28676 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCAP28676 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCAP28676 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCAP28676 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCAP28676 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCAP28676 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCAP28676 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCAP28676 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GCAP28676 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GCAP28676 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCAP28676 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCAP28676 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCAP28676 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCAP28676 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCAP28676 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCAP28676 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCAP28676 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCAP28676 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCAP28676 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCAP28676 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCAP28676 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCAP28676 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCAP28676 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCAP28676 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCAP28676 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCAP28676 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCAP28676 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms