Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SSFA2P28290 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms