Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MARK3P27448 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARK3P27448 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARK3P27448 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARK3P27448 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MARK3P27448 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARK3P27448 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARK3P27448 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARK3P27448 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARK3P27448 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARK3P27448 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARK3P27448 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARK3P27448 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARK3P27448 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARK3P27448 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARK3P27448 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARK3P27448 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARK3P27448 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARK3P27448 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARK3P27448 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MARK3P27448 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARK3P27448 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MARK3P27448 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARK3P27448 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARK3P27448 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARK3P27448 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARK3P27448 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARK3P27448 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARK3P27448 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARK3P27448 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARK3P27448 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARK3P27448 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARK3P27448 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARK3P27448 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARK3P27448 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARK3P27448 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARK3P27448 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MARK3P27448 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARK3P27448 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARK3P27448 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARK3P27448 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARK3P27448 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARK3P27448 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARK3P27448 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MARK3P27448 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARK3P27448 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARK3P27448 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARK3P27448 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARK3P27448 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARK3P27448 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MARK3P27448 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARK3P27448 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARK3P27448 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARK3P27448 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARK3P27448 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARK3P27448 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARK3P27448 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARK3P27448 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARK3P27448 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARK3P27448 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARK3P27448 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARK3P27448 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARK3P27448 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MARK3P27448 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARK3P27448 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARK3P27448 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARK3P27448 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARK3P27448 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARK3P27448 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARK3P27448 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MARK3P27448 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARK3P27448 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARK3P27448 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARK3P27448 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARK3P27448 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARK3P27448 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARK3P27448 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARK3P27448 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARK3P27448 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARK3P27448 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MARK3P27448 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARK3P27448 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARK3P27448 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARK3P27448 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARK3P27448 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARK3P27448 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARK3P27448 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARK3P27448 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARK3P27448 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARK3P27448 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARK3P27448 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARK3P27448 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARK3P27448 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARK3P27448 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARK3P27448 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARK3P27448 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARK3P27448 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARK3P27448 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARK3P27448 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARK3P27448 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 356.6 ms