Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMLP26374 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMLP26374 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMLP26374 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMLP26374 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMLP26374 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMLP26374 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMLP26374 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMLP26374 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMLP26374 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMLP26374 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMLP26374 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMLP26374 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMLP26374 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMLP26374 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMLP26374 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMLP26374 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMLP26374 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMLP26374 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMLP26374 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMLP26374 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMLP26374 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMLP26374 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMLP26374 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMLP26374 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMLP26374 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMLP26374 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMLP26374 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMLP26374 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMLP26374 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMLP26374 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMLP26374 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMLP26374 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMLP26374 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMLP26374 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMLP26374 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMLP26374 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMLP26374 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMLP26374 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMLP26374 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMLP26374 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMLP26374 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMLP26374 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMLP26374 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMLP26374 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMLP26374 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMLP26374 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMLP26374 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMLP26374 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMLP26374 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMLP26374 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMLP26374 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMLP26374 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMLP26374 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMLP26374 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMLP26374 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMLP26374 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMLP26374 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMLP26374 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMLP26374 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMLP26374 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMLP26374 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMLP26374 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMLP26374 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMLP26374 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMLP26374 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMLP26374 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMLP26374 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMLP26374 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMLP26374 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMLP26374 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMLP26374 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMLP26374 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMLP26374 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMLP26374 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMLP26374 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMLP26374 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMLP26374 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHMLP26374 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHMLP26374 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHMLP26374 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CHMLP26374 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMLP26374 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMLP26374 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMLP26374 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMLP26374 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMLP26374 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMLP26374 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMLP26374 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMLP26374 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMLP26374 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMLP26374 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMLP26374 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMLP26374 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMLP26374 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMLP26374 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMLP26374 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMLP26374 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMLP26374 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMLP26374 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms