Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms