Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPREP23469 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPREP23469 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPREP23469 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPREP23469 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPREP23469 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPREP23469 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPREP23469 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPREP23469 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPREP23469 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPREP23469 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPREP23469 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPREP23469 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPREP23469 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPREP23469 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPREP23469 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPREP23469 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPREP23469 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPREP23469 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPREP23469 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPREP23469 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPREP23469 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPREP23469 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPREP23469 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPREP23469 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPREP23469 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPREP23469 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPREP23469 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPREP23469 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPREP23469 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPREP23469 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPREP23469 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPREP23469 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPREP23469 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPREP23469 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPREP23469 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPREP23469 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPREP23469 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPREP23469 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPREP23469 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPREP23469 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPREP23469 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPREP23469 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPREP23469 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPREP23469 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPREP23469 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPREP23469 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPREP23469 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPREP23469 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPREP23469 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPREP23469 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPREP23469 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPREP23469 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPREP23469 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPREP23469 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPREP23469 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPREP23469 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPREP23469 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPREP23469 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPREP23469 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPREP23469 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPREP23469 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPREP23469 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPREP23469 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPREP23469 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPREP23469 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPREP23469 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPREP23469 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPREP23469 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPREP23469 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPREP23469 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPREP23469 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPREP23469 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPREP23469 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPREP23469 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPREP23469 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPREP23469 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPREP23469 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPREP23469 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPREP23469 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPREP23469 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPREP23469 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPREP23469 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPREP23469 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPREP23469 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPREP23469 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPREP23469 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPREP23469 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPREP23469 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPREP23469 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPREP23469 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPREP23469 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPREP23469 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPREP23469 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPREP23469 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPREP23469 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPREP23469 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPREP23469 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPREP23469 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPREP23469 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms