Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF1P21675 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF1P21675 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF1P21675 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF1P21675 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF1P21675 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF1P21675 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF1P21675 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF1P21675 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF1P21675 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF1P21675 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF1P21675 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF1P21675 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF1P21675 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF1P21675 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1P21675 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1P21675 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1P21675 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1P21675 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1P21675 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1P21675 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1P21675 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1P21675 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1P21675 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1P21675 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1P21675 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF1P21675 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF1P21675 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF1P21675 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF1P21675 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF1P21675 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF1P21675 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF1P21675 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF1P21675 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF1P21675 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF1P21675 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF1P21675 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF1P21675 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF1P21675 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF1P21675 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF1P21675 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF1P21675 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TAF1P21675 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TAF1P21675 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TAF1P21675 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TAF1P21675 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TAF1P21675 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1P21675 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1P21675 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1P21675 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1P21675 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1P21675 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1P21675 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1P21675 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1P21675 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1P21675 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1P21675 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1P21675 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1P21675 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1P21675 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1P21675 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1P21675 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1P21675 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1P21675 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1P21675 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1P21675 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF1P21675 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF1P21675 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF1P21675 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF1P21675 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF1P21675 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF1P21675 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF1P21675 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF1P21675 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF1P21675 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF1P21675 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF1P21675 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF1P21675 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF1P21675 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF1P21675 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF1P21675 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF1P21675 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF1P21675 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF1P21675 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF1P21675 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF1P21675 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF1P21675 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF1P21675 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF1P21675 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF1P21675 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF1P21675 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF1P21675 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF1P21675 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF1P21675 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF1P21675 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF1P21675 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF1P21675 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF1P21675 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF1P21675 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF1P21675 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms