Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYT1P21579 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYT1P21579 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYT1P21579 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYT1P21579 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYT1P21579 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYT1P21579 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYT1P21579 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SYT1P21579 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYT1P21579 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYT1P21579 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYT1P21579 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYT1P21579 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYT1P21579 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYT1P21579 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYT1P21579 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYT1P21579 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYT1P21579 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYT1P21579 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYT1P21579 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYT1P21579 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYT1P21579 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYT1P21579 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYT1P21579 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYT1P21579 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYT1P21579 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYT1P21579 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYT1P21579 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYT1P21579 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SYT1P21579 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYT1P21579 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYT1P21579 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SYT1P21579 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SYT1P21579 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SYT1P21579 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYT1P21579 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYT1P21579 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYT1P21579 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYT1P21579 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SYT1P21579 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYT1P21579 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYT1P21579 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYT1P21579 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYT1P21579 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYT1P21579 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYT1P21579 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYT1P21579 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYT1P21579 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT1P21579 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT1P21579 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT1P21579 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT1P21579 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT1P21579 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT1P21579 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT1P21579 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT1P21579 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT1P21579 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT1P21579 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT1P21579 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT1P21579 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT1P21579 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT1P21579 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT1P21579 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT1P21579 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT1P21579 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT1P21579 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT1P21579 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT1P21579 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT1P21579 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT1P21579 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT1P21579 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT1P21579 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT1P21579 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT1P21579 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT1P21579 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT1P21579 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT1P21579 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT1P21579 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT1P21579 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT1P21579 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT1P21579 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT1P21579 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT1P21579 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT1P21579 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT1P21579 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT1P21579 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT1P21579 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT1P21579 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT1P21579 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT1P21579 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT1P21579 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT1P21579 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT1P21579 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT1P21579 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT1P21579 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT1P21579 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT1P21579 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT1P21579 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT1P21579 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT1P21579 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms