Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCP20941 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCP20941 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCP20941 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCP20941 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCP20941 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCP20941 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCP20941 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCP20941 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCP20941 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCP20941 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCP20941 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCP20941 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCP20941 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCP20941 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCP20941 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCP20941 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCP20941 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCP20941 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCP20941 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCP20941 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCP20941 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCP20941 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCP20941 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCP20941 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCP20941 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCP20941 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCP20941 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCP20941 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCP20941 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCP20941 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCP20941 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCP20941 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCP20941 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCP20941 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCP20941 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCP20941 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCP20941 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCP20941 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCP20941 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCP20941 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCP20941 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCP20941 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCP20941 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDCP20941 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCP20941 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCP20941 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCP20941 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCP20941 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCP20941 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCP20941 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCP20941 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCP20941 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCP20941 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCP20941 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCP20941 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCP20941 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCP20941 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCP20941 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCP20941 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCP20941 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCP20941 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCP20941 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCP20941 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCP20941 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCP20941 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCP20941 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCP20941 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCP20941 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCP20941 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCP20941 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCP20941 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCP20941 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCP20941 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCP20941 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCP20941 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCP20941 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCP20941 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCP20941 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCP20941 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCP20941 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCP20941 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCP20941 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCP20941 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCP20941 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCP20941 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCP20941 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCP20941 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCP20941 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCP20941 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCP20941 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCP20941 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCP20941 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCP20941 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCP20941 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCP20941 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCP20941 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCP20941 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCP20941 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCP20941 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms