Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF3P20783 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF3P20783 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF3P20783 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF3P20783 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF3P20783 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF3P20783 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF3P20783 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF3P20783 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF3P20783 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF3P20783 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF3P20783 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF3P20783 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF3P20783 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF3P20783 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF3P20783 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF3P20783 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF3P20783 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF3P20783 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF3P20783 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF3P20783 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF3P20783 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF3P20783 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF3P20783 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF3P20783 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF3P20783 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF3P20783 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF3P20783 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF3P20783 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF3P20783 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF3P20783 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF3P20783 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF3P20783 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF3P20783 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF3P20783 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF3P20783 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF3P20783 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF3P20783 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF3P20783 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF3P20783 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF3P20783 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF3P20783 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF3P20783 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF3P20783 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF3P20783 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTF3P20783 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF3P20783 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF3P20783 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF3P20783 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF3P20783 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF3P20783 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF3P20783 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF3P20783 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF3P20783 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF3P20783 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF3P20783 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF3P20783 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF3P20783 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF3P20783 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF3P20783 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF3P20783 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF3P20783 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF3P20783 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF3P20783 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF3P20783 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF3P20783 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF3P20783 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF3P20783 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF3P20783 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF3P20783 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF3P20783 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF3P20783 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF3P20783 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF3P20783 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF3P20783 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF3P20783 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF3P20783 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF3P20783 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF3P20783 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF3P20783 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTF3P20783 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF3P20783 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF3P20783 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF3P20783 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF3P20783 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF3P20783 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF3P20783 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF3P20783 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF3P20783 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF3P20783 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF3P20783 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF3P20783 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF3P20783 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF3P20783 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF3P20783 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF3P20783 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF3P20783 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF3P20783 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF3P20783 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF3P20783 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms