Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMB1P20618 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms