Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A1P19634 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms