Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRAP18433 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
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