Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCP1P17987 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCP1P17987 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCP1P17987 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCP1P17987 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCP1P17987 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCP1P17987 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCP1P17987 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCP1P17987 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCP1P17987 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCP1P17987 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCP1P17987 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCP1P17987 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCP1P17987 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCP1P17987 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCP1P17987 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCP1P17987 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCP1P17987 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCP1P17987 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TCP1P17987 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCP1P17987 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCP1P17987 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCP1P17987 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCP1P17987 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCP1P17987 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCP1P17987 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCP1P17987 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCP1P17987 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCP1P17987 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCP1P17987 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCP1P17987 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCP1P17987 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCP1P17987 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TCP1P17987 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCP1P17987 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCP1P17987 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCP1P17987 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCP1P17987 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCP1P17987 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCP1P17987 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCP1P17987 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCP1P17987 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCP1P17987 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCP1P17987 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCP1P17987 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCP1P17987 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCP1P17987 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCP1P17987 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCP1P17987 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TCP1P17987 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCP1P17987 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCP1P17987 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCP1P17987 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCP1P17987 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCP1P17987 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCP1P17987 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCP1P17987 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCP1P17987 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCP1P17987 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCP1P17987 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TCP1P17987 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCP1P17987 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCP1P17987 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCP1P17987 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TCP1P17987 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TCP1P17987 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCP1P17987 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCP1P17987 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCP1P17987 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCP1P17987 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCP1P17987 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCP1P17987 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCP1P17987 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCP1P17987 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCP1P17987 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCP1P17987 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCP1P17987 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCP1P17987 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCP1P17987 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCP1P17987 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCP1P17987 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCP1P17987 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TCP1P17987 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCP1P17987 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCP1P17987 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCP1P17987 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCP1P17987 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCP1P17987 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCP1P17987 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TCP1P17987 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCP1P17987 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCP1P17987 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCP1P17987 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCP1P17987 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCP1P17987 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCP1P17987 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCP1P17987 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCP1P17987 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCP1P17987 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCP1P17987 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms