Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms