Protein–RNA interactions for Protein: P13637

ATP1A3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A3P13637 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP1A3P13637 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP1A3P13637 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A3P13637 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms