Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYL1P12980 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LYL1P12980 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LYL1P12980 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LYL1P12980 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYL1P12980 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYL1P12980 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYL1P12980 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYL1P12980 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYL1P12980 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYL1P12980 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYL1P12980 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYL1P12980 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYL1P12980 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYL1P12980 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYL1P12980 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYL1P12980 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYL1P12980 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYL1P12980 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LYL1P12980 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYL1P12980 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYL1P12980 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYL1P12980 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYL1P12980 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LYL1P12980 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LYL1P12980 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LYL1P12980 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LYL1P12980 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYL1P12980 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYL1P12980 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYL1P12980 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYL1P12980 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYL1P12980 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYL1P12980 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYL1P12980 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYL1P12980 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYL1P12980 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LYL1P12980 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYL1P12980 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LYL1P12980 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYL1P12980 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYL1P12980 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYL1P12980 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYL1P12980 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYL1P12980 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYL1P12980 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYL1P12980 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYL1P12980 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LYL1P12980 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYL1P12980 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LYL1P12980 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYL1P12980 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYL1P12980 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYL1P12980 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYL1P12980 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYL1P12980 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYL1P12980 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYL1P12980 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYL1P12980 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYL1P12980 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYL1P12980 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYL1P12980 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYL1P12980 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYL1P12980 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYL1P12980 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYL1P12980 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYL1P12980 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYL1P12980 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYL1P12980 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LYL1P12980 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYL1P12980 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYL1P12980 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYL1P12980 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYL1P12980 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYL1P12980 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYL1P12980 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYL1P12980 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYL1P12980 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYL1P12980 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYL1P12980 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYL1P12980 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYL1P12980 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYL1P12980 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LYL1P12980 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYL1P12980 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYL1P12980 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LYL1P12980 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LYL1P12980 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LYL1P12980 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LYL1P12980 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYL1P12980 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LYL1P12980 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYL1P12980 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYL1P12980 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYL1P12980 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYL1P12980 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYL1P12980 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYL1P12980 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYL1P12980 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYL1P12980 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms