Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms