Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIP12755 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIP12755 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIP12755 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIP12755 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIP12755 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIP12755 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIP12755 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIP12755 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIP12755 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIP12755 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIP12755 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIP12755 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIP12755 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIP12755 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIP12755 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIP12755 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIP12755 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIP12755 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIP12755 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIP12755 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIP12755 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIP12755 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIP12755 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIP12755 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIP12755 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIP12755 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIP12755 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIP12755 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIP12755 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIP12755 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIP12755 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIP12755 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIP12755 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIP12755 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIP12755 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIP12755 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIP12755 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIP12755 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIP12755 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIP12755 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIP12755 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIP12755 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIP12755 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIP12755 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIP12755 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIP12755 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIP12755 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIP12755 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SKIP12755 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SKIP12755 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIP12755 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIP12755 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIP12755 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIP12755 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIP12755 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIP12755 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIP12755 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIP12755 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIP12755 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIP12755 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIP12755 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIP12755 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIP12755 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIP12755 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIP12755 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIP12755 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIP12755 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIP12755 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIP12755 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIP12755 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIP12755 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIP12755 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIP12755 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIP12755 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIP12755 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIP12755 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIP12755 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKIP12755 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKIP12755 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SKIP12755 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKIP12755 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKIP12755 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKIP12755 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKIP12755 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKIP12755 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKIP12755 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKIP12755 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKIP12755 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKIP12755 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SKIP12755 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKIP12755 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKIP12755 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKIP12755 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKIP12755 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKIP12755 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKIP12755 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKIP12755 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKIP12755 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKIP12755 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms