Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP1P11387 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP1P11387 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP1P11387 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP1P11387 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP1P11387 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP1P11387 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP1P11387 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP1P11387 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP1P11387 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP1P11387 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP1P11387 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP1P11387 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP1P11387 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP1P11387 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP1P11387 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP1P11387 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP1P11387 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP1P11387 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP1P11387 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP1P11387 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP1P11387 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP1P11387 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP1P11387 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP1P11387 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP1P11387 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP1P11387 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP1P11387 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP1P11387 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP1P11387 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP1P11387 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP1P11387 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP1P11387 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP1P11387 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP1P11387 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP1P11387 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP1P11387 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP1P11387 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP1P11387 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP1P11387 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP1P11387 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP1P11387 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP1P11387 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TOP1P11387 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TOP1P11387 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOP1P11387 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOP1P11387 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOP1P11387 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOP1P11387 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOP1P11387 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOP1P11387 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP1P11387 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP1P11387 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP1P11387 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP1P11387 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP1P11387 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP1P11387 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP1P11387 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP1P11387 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP1P11387 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP1P11387 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP1P11387 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP1P11387 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP1P11387 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP1P11387 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP1P11387 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP1P11387 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP1P11387 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP1P11387 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP1P11387 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP1P11387 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP1P11387 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP1P11387 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP1P11387 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP1P11387 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP1P11387 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP1P11387 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP1P11387 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP1P11387 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP1P11387 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP1P11387 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP1P11387 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP1P11387 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP1P11387 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP1P11387 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP1P11387 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP1P11387 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP1P11387 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP1P11387 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP1P11387 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP1P11387 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP1P11387 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP1P11387 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP1P11387 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP1P11387 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP1P11387 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP1P11387 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP1P11387 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP1P11387 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP1P11387 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms