Protein–RNA interactions for Protein: P11055

MYH3, Myosin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH3P11055 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYH3P11055 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYH3P11055 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYH3P11055 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYH3P11055 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MYH3P11055 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYH3P11055 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYH3P11055 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYH3P11055 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYH3P11055 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYH3P11055 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYH3P11055 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MYH3P11055 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYH3P11055 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYH3P11055 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYH3P11055 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYH3P11055 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYH3P11055 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYH3P11055 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYH3P11055 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYH3P11055 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYH3P11055 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYH3P11055 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYH3P11055 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYH3P11055 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYH3P11055 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MYH3P11055 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYH3P11055 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYH3P11055 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYH3P11055 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MYH3P11055 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYH3P11055 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYH3P11055 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYH3P11055 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYH3P11055 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYH3P11055 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYH3P11055 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYH3P11055 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYH3P11055 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MYH3P11055 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYH3P11055 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MYH3P11055 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYH3P11055 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYH3P11055 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYH3P11055 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYH3P11055 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYH3P11055 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYH3P11055 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYH3P11055 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYH3P11055 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYH3P11055 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYH3P11055 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYH3P11055 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYH3P11055 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYH3P11055 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYH3P11055 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYH3P11055 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MYH3P11055 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYH3P11055 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYH3P11055 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYH3P11055 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYH3P11055 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYH3P11055 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYH3P11055 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYH3P11055 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYH3P11055 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYH3P11055 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYH3P11055 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYH3P11055 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYH3P11055 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYH3P11055 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYH3P11055 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYH3P11055 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYH3P11055 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYH3P11055 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYH3P11055 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MYH3P11055 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYH3P11055 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYH3P11055 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYH3P11055 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYH3P11055 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYH3P11055 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYH3P11055 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYH3P11055 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYH3P11055 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYH3P11055 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYH3P11055 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYH3P11055 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYH3P11055 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYH3P11055 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYH3P11055 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MYH3P11055 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYH3P11055 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYH3P11055 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYH3P11055 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYH3P11055 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYH3P11055 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYH3P11055 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYH3P11055 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYH3P11055 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms