Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms