Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GLI3P10071 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GLI3P10071 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GLI3P10071 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GLI3P10071 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GLI3P10071 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GLI3P10071 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GLI3P10071 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GLI3P10071 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GLI3P10071 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GLI3P10071 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GLI3P10071 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GLI3P10071 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GLI3P10071 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GLI3P10071 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GLI3P10071 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GLI3P10071 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GLI3P10071 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GLI3P10071 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
GLI3P10071 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GLI3P10071 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GLI3P10071 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GLI3P10071 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
GLI3P10071 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GLI3P10071 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
GLI3P10071 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GLI3P10071 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GLI3P10071 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GLI3P10071 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GLI3P10071 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GLI3P10071 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GLI3P10071 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GLI3P10071 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GLI3P10071 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GLI3P10071 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GLI3P10071 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GLI3P10071 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GLI3P10071 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GLI3P10071 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GLI3P10071 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GLI3P10071 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GLI3P10071 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GLI3P10071 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GLI3P10071 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GLI3P10071 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GLI3P10071 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GLI3P10071 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GLI3P10071 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GLI3P10071 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GLI3P10071 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GLI3P10071 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GLI3P10071 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GLI3P10071 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GLI3P10071 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GLI3P10071 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GLI3P10071 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GLI3P10071 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GLI3P10071 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GLI3P10071 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GLI3P10071 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GLI3P10071 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GLI3P10071 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GLI3P10071 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GLI3P10071 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GLI3P10071 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GLI3P10071 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GLI3P10071 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GLI3P10071 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GLI3P10071 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GLI3P10071 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GLI3P10071 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GLI3P10071 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GLI3P10071 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GLI3P10071 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GLI3P10071 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GLI3P10071 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GLI3P10071 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GLI3P10071 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
GLI3P10071 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GLI3P10071 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
GLI3P10071 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GLI3P10071 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GLI3P10071 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GLI3P10071 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GLI3P10071 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GLI3P10071 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GLI3P10071 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GLI3P10071 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GLI3P10071 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GLI3P10071 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GLI3P10071 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GLI3P10071 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GLI3P10071 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GLI3P10071 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GLI3P10071 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GLI3P10071 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GLI3P10071 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GLI3P10071 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GLI3P10071 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GLI3P10071 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms