Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms