Protein–RNA interactions for Protein: P08195

SLC3A2, 4F2 cell-surface antigen heavy chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A2P08195 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC3A2P08195 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC3A2P08195 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC3A2P08195 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC3A2P08195 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC3A2P08195 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC3A2P08195 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC3A2P08195 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC3A2P08195 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC3A2P08195 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC3A2P08195 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC3A2P08195 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC3A2P08195 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC3A2P08195 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC3A2P08195 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC3A2P08195 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC3A2P08195 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms