Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPBP07199 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPBP07199 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPBP07199 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPBP07199 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPBP07199 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPBP07199 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPBP07199 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPBP07199 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPBP07199 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPBP07199 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPBP07199 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPBP07199 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPBP07199 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPBP07199 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPBP07199 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPBP07199 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPBP07199 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPBP07199 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPBP07199 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPBP07199 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPBP07199 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPBP07199 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPBP07199 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPBP07199 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CENPBP07199 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CENPBP07199 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPBP07199 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPBP07199 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPBP07199 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPBP07199 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPBP07199 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPBP07199 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPBP07199 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPBP07199 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPBP07199 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPBP07199 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPBP07199 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPBP07199 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPBP07199 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CENPBP07199 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CENPBP07199 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CENPBP07199 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CENPBP07199 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CENPBP07199 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CENPBP07199 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CENPBP07199 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CENPBP07199 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CENPBP07199 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CENPBP07199 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CENPBP07199 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CENPBP07199 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CENPBP07199 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CENPBP07199 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CENPBP07199 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CENPBP07199 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CENPBP07199 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CENPBP07199 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CENPBP07199 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CENPBP07199 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CENPBP07199 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CENPBP07199 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CENPBP07199 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CENPBP07199 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CENPBP07199 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CENPBP07199 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CENPBP07199 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CENPBP07199 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CENPBP07199 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CENPBP07199 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CENPBP07199 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CENPBP07199 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CENPBP07199 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CENPBP07199 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CENPBP07199 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CENPBP07199 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CENPBP07199 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CENPBP07199 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CENPBP07199 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CENPBP07199 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CENPBP07199 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CENPBP07199 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CENPBP07199 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CENPBP07199 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CENPBP07199 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CENPBP07199 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CENPBP07199 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CENPBP07199 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CENPBP07199 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CENPBP07199 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CENPBP07199 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CENPBP07199 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CENPBP07199 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CENPBP07199 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CENPBP07199 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CENPBP07199 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CENPBP07199 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CENPBP07199 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CENPBP07199 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CENPBP07199 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms