Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms