Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCCAP05165 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCCAP05165 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCCAP05165 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCCAP05165 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCCAP05165 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PCCAP05165 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCCAP05165 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCCAP05165 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCCAP05165 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCCAP05165 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCCAP05165 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCCAP05165 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCCAP05165 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCCAP05165 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCCAP05165 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCCAP05165 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCCAP05165 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCCAP05165 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCCAP05165 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCCAP05165 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCCAP05165 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCCAP05165 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCCAP05165 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCCAP05165 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCCAP05165 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCCAP05165 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCCAP05165 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCCAP05165 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCCAP05165 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCCAP05165 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCCAP05165 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCCAP05165 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCCAP05165 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCCAP05165 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCCAP05165 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCCAP05165 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCCAP05165 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCCAP05165 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCCAP05165 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCCAP05165 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCCAP05165 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCCAP05165 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCCAP05165 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCCAP05165 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCCAP05165 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCCAP05165 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCCAP05165 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCCAP05165 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PCCAP05165 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCCAP05165 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCCAP05165 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCCAP05165 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCCAP05165 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCCAP05165 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCCAP05165 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCCAP05165 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCCAP05165 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCCAP05165 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCCAP05165 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCCAP05165 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCCAP05165 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCCAP05165 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCCAP05165 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCCAP05165 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCCAP05165 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PCCAP05165 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCCAP05165 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCCAP05165 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCCAP05165 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCCAP05165 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCCAP05165 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCCAP05165 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCCAP05165 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PCCAP05165 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCCAP05165 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCCAP05165 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCCAP05165 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCCAP05165 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCCAP05165 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCCAP05165 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCCAP05165 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCCAP05165 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCCAP05165 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCCAP05165 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCCAP05165 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCCAP05165 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCCAP05165 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCCAP05165 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCCAP05165 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCCAP05165 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCCAP05165 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCCAP05165 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCCAP05165 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PCCAP05165 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCCAP05165 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCCAP05165 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCCAP05165 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCCAP05165 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCCAP05165 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms