Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYF2O95926 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYF2O95926 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYF2O95926 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYF2O95926 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYF2O95926 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYF2O95926 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYF2O95926 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYF2O95926 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYF2O95926 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYF2O95926 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYF2O95926 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SYF2O95926 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SYF2O95926 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYF2O95926 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYF2O95926 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYF2O95926 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SYF2O95926 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYF2O95926 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYF2O95926 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYF2O95926 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYF2O95926 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYF2O95926 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SYF2O95926 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYF2O95926 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYF2O95926 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYF2O95926 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYF2O95926 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYF2O95926 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYF2O95926 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYF2O95926 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYF2O95926 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYF2O95926 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYF2O95926 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYF2O95926 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYF2O95926 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYF2O95926 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SYF2O95926 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYF2O95926 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYF2O95926 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYF2O95926 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYF2O95926 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYF2O95926 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYF2O95926 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYF2O95926 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYF2O95926 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYF2O95926 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYF2O95926 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYF2O95926 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYF2O95926 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYF2O95926 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYF2O95926 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYF2O95926 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYF2O95926 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYF2O95926 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYF2O95926 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYF2O95926 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYF2O95926 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYF2O95926 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYF2O95926 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYF2O95926 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYF2O95926 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SYF2O95926 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SYF2O95926 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYF2O95926 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SYF2O95926 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYF2O95926 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYF2O95926 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYF2O95926 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYF2O95926 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYF2O95926 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SYF2O95926 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SYF2O95926 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYF2O95926 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYF2O95926 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYF2O95926 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYF2O95926 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYF2O95926 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYF2O95926 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYF2O95926 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYF2O95926 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYF2O95926 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYF2O95926 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYF2O95926 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYF2O95926 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYF2O95926 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYF2O95926 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYF2O95926 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYF2O95926 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYF2O95926 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYF2O95926 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYF2O95926 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYF2O95926 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYF2O95926 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYF2O95926 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYF2O95926 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYF2O95926 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYF2O95926 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SYF2O95926 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYF2O95926 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms