Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX58O95786 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX58O95786 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX58O95786 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX58O95786 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX58O95786 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX58O95786 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX58O95786 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX58O95786 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX58O95786 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX58O95786 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX58O95786 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX58O95786 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX58O95786 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX58O95786 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX58O95786 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX58O95786 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX58O95786 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX58O95786 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX58O95786 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX58O95786 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX58O95786 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX58O95786 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX58O95786 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX58O95786 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX58O95786 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX58O95786 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX58O95786 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX58O95786 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX58O95786 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX58O95786 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX58O95786 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX58O95786 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX58O95786 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX58O95786 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX58O95786 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX58O95786 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX58O95786 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX58O95786 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX58O95786 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX58O95786 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX58O95786 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX58O95786 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX58O95786 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX58O95786 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX58O95786 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX58O95786 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
DDX58O95786 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
DDX58O95786 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
DDX58O95786 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX58O95786 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX58O95786 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX58O95786 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX58O95786 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX58O95786 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX58O95786 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX58O95786 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX58O95786 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX58O95786 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX58O95786 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX58O95786 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX58O95786 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX58O95786 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX58O95786 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX58O95786 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX58O95786 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX58O95786 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX58O95786 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX58O95786 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX58O95786 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX58O95786 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX58O95786 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX58O95786 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX58O95786 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX58O95786 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX58O95786 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX58O95786 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX58O95786 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX58O95786 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX58O95786 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX58O95786 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX58O95786 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX58O95786 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX58O95786 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX58O95786 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX58O95786 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX58O95786 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX58O95786 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX58O95786 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX58O95786 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX58O95786 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX58O95786 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX58O95786 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX58O95786 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX58O95786 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX58O95786 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX58O95786 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX58O95786 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX58O95786 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX58O95786 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms