Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCNTO95613 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCNTO95613 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCNTO95613 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCNTO95613 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PCNTO95613 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCNTO95613 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCNTO95613 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCNTO95613 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCNTO95613 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCNTO95613 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCNTO95613 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCNTO95613 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCNTO95613 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCNTO95613 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCNTO95613 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCNTO95613 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCNTO95613 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCNTO95613 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCNTO95613 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCNTO95613 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCNTO95613 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCNTO95613 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCNTO95613 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCNTO95613 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PCNTO95613 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCNTO95613 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCNTO95613 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCNTO95613 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PCNTO95613 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCNTO95613 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCNTO95613 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PCNTO95613 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PCNTO95613 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCNTO95613 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCNTO95613 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PCNTO95613 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCNTO95613 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCNTO95613 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCNTO95613 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCNTO95613 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PCNTO95613 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCNTO95613 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCNTO95613 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCNTO95613 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCNTO95613 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCNTO95613 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCNTO95613 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCNTO95613 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCNTO95613 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCNTO95613 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCNTO95613 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCNTO95613 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCNTO95613 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCNTO95613 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCNTO95613 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCNTO95613 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PCNTO95613 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCNTO95613 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCNTO95613 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCNTO95613 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCNTO95613 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCNTO95613 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCNTO95613 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCNTO95613 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCNTO95613 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCNTO95613 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCNTO95613 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCNTO95613 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCNTO95613 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCNTO95613 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCNTO95613 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCNTO95613 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCNTO95613 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCNTO95613 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCNTO95613 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCNTO95613 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PCNTO95613 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCNTO95613 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCNTO95613 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCNTO95613 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PCNTO95613 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCNTO95613 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCNTO95613 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCNTO95613 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCNTO95613 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCNTO95613 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCNTO95613 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCNTO95613 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCNTO95613 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PCNTO95613 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCNTO95613 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PCNTO95613 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCNTO95613 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PCNTO95613 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PCNTO95613 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCNTO95613 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCNTO95613 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCNTO95613 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PCNTO95613 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms