Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms