Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF4AO95239 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms