Protein–RNA interactions for Protein: O75604

USP2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP2O75604 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP2O75604 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP2O75604 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP2O75604 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP2O75604 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP2O75604 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP2O75604 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP2O75604 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP2O75604 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP2O75604 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP2O75604 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP2O75604 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP2O75604 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP2O75604 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP2O75604 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP2O75604 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP2O75604 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP2O75604 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP2O75604 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP2O75604 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP2O75604 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP2O75604 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP2O75604 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP2O75604 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP2O75604 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP2O75604 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP2O75604 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP2O75604 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP2O75604 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP2O75604 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP2O75604 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP2O75604 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP2O75604 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP2O75604 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP2O75604 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP2O75604 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
USP2O75604 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP2O75604 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP2O75604 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP2O75604 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP2O75604 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP2O75604 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP2O75604 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP2O75604 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP2O75604 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP2O75604 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP2O75604 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP2O75604 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP2O75604 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP2O75604 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP2O75604 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP2O75604 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
USP2O75604 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP2O75604 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP2O75604 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP2O75604 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP2O75604 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP2O75604 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP2O75604 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP2O75604 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP2O75604 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP2O75604 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
USP2O75604 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP2O75604 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP2O75604 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
USP2O75604 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP2O75604 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP2O75604 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP2O75604 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP2O75604 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP2O75604 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
USP2O75604 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP2O75604 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP2O75604 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP2O75604 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP2O75604 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP2O75604 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
USP2O75604 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP2O75604 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP2O75604 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP2O75604 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP2O75604 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP2O75604 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP2O75604 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP2O75604 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP2O75604 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
USP2O75604 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP2O75604 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP2O75604 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP2O75604 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
USP2O75604 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP2O75604 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP2O75604 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP2O75604 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP2O75604 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP2O75604 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP2O75604 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP2O75604 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP2O75604 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP2O75604 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms