Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms