Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms