Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NPHP4O75161 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NPHP4O75161 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NPHP4O75161 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NPHP4O75161 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NPHP4O75161 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NPHP4O75161 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NPHP4O75161 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NPHP4O75161 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NPHP4O75161 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NPHP4O75161 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NPHP4O75161 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NPHP4O75161 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NPHP4O75161 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NPHP4O75161 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NPHP4O75161 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NPHP4O75161 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NPHP4O75161 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NPHP4O75161 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NPHP4O75161 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NPHP4O75161 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NPHP4O75161 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NPHP4O75161 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NPHP4O75161 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NPHP4O75161 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NPHP4O75161 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NPHP4O75161 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NPHP4O75161 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NPHP4O75161 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NPHP4O75161 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NPHP4O75161 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NPHP4O75161 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NPHP4O75161 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NPHP4O75161 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NPHP4O75161 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NPHP4O75161 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NPHP4O75161 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NPHP4O75161 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NPHP4O75161 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NPHP4O75161 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NPHP4O75161 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NPHP4O75161 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NPHP4O75161 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NPHP4O75161 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NPHP4O75161 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms