Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBNO60934 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBNO60934 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBNO60934 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBNO60934 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBNO60934 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBNO60934 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBNO60934 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBNO60934 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBNO60934 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBNO60934 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBNO60934 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBNO60934 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBNO60934 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBNO60934 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBNO60934 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBNO60934 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBNO60934 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBNO60934 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBNO60934 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBNO60934 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBNO60934 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBNO60934 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBNO60934 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NBNO60934 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBNO60934 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NBNO60934 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBNO60934 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBNO60934 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBNO60934 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NBNO60934 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBNO60934 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NBNO60934 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBNO60934 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBNO60934 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBNO60934 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBNO60934 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBNO60934 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBNO60934 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBNO60934 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBNO60934 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBNO60934 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBNO60934 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBNO60934 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NBNO60934 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBNO60934 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBNO60934 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBNO60934 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBNO60934 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBNO60934 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBNO60934 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBNO60934 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBNO60934 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBNO60934 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBNO60934 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBNO60934 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBNO60934 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBNO60934 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NBNO60934 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NBNO60934 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBNO60934 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBNO60934 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBNO60934 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBNO60934 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBNO60934 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBNO60934 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBNO60934 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBNO60934 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBNO60934 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBNO60934 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBNO60934 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBNO60934 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBNO60934 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBNO60934 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBNO60934 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBNO60934 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBNO60934 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBNO60934 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBNO60934 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBNO60934 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBNO60934 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBNO60934 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBNO60934 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBNO60934 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBNO60934 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBNO60934 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBNO60934 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBNO60934 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBNO60934 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBNO60934 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBNO60934 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBNO60934 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBNO60934 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBNO60934 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBNO60934 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBNO60934 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBNO60934 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBNO60934 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBNO60934 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBNO60934 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms