Protein–RNA interactions for Protein: O60683

PEX10, Peroxisome biogenesis factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX10O60683 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX10O60683 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX10O60683 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX10O60683 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX10O60683 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX10O60683 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX10O60683 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX10O60683 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX10O60683 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX10O60683 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX10O60683 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX10O60683 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX10O60683 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX10O60683 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX10O60683 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX10O60683 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX10O60683 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX10O60683 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX10O60683 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX10O60683 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX10O60683 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX10O60683 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX10O60683 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX10O60683 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX10O60683 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX10O60683 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX10O60683 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX10O60683 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX10O60683 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX10O60683 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX10O60683 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX10O60683 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX10O60683 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX10O60683 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX10O60683 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX10O60683 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX10O60683 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX10O60683 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX10O60683 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX10O60683 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX10O60683 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX10O60683 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX10O60683 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX10O60683 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX10O60683 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX10O60683 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX10O60683 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX10O60683 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX10O60683 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX10O60683 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX10O60683 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX10O60683 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX10O60683 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX10O60683 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX10O60683 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX10O60683 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX10O60683 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX10O60683 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX10O60683 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX10O60683 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX10O60683 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX10O60683 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PEX10O60683 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PEX10O60683 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PEX10O60683 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX10O60683 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX10O60683 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX10O60683 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX10O60683 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX10O60683 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX10O60683 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX10O60683 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX10O60683 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX10O60683 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX10O60683 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX10O60683 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX10O60683 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX10O60683 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX10O60683 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX10O60683 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX10O60683 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX10O60683 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX10O60683 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX10O60683 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX10O60683 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX10O60683 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX10O60683 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX10O60683 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX10O60683 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX10O60683 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX10O60683 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX10O60683 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX10O60683 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX10O60683 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX10O60683 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX10O60683 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX10O60683 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX10O60683 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX10O60683 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX10O60683 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms